湖州市水上應急救援中心設在太湖水上搜救中心，具體負責搜救中心的日常管理。該中心是2013年初經湖州市編委批準成立的公益一類副科級事業單位，隸屬于湖州市港航管理局，主要工作職能是：貫徹執行《內河交通安全管理條例》等有關法律法規；承擔水上突發事件應急搶險的救助和處置；承擔沉船、沉物、航道礙航物的清除打撈；組織開展水上搜救應急演練；承擔水上交通戰備保障和搶險工作，開展專業訓練和戰備演習。

2014年3月15日，湖州港航水上搜救中心通過多方面咨詢和考量，終選擇杭州利旺智能科技有限公司自主品牌FARCOM遠通 FC-VGA1616指揮中心用VGA矩陣產品，目前已投入使用，用戶反應良好。